HyperChem Pro 8.0
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HyperProtein 1.0

HyperProtein은 Hypercube사에서 단백질 시퀀스와 관련된 컴퓨터 기술(과학)에 포커스를 맞춘 새로운 제품입니다. 이 제품은 1차원 단백질 시퀀스의 해석과 3차원의 일관된 단백질 구조의 분석을 포함하고 있습니다. 특히, 시퀀스와 구조 간의 관계는 본 제품의 주요한 부분입니다. 시퀀스 얼라이먼트 같이 단백질 시퀀스 또는 구조의 일부에 대한 것을 제공하는 개별 소프트웨어와 달리 HyperProtein은 단백질 시퀀스로 시작된 과학 관련 생물 정보학과 분자 모델링 툴 다수로 구성되어있습니다.  HyperProtein은 완전히 새로운 경지의 단백질 시뮬레이션을 보여줍니다.HyperProtein은 시퀀스 한가지 또는 일련의 대표적인 단백질군 시퀀스로 시작합니다. 즉, HyperProtein은 대표적인 여러 종의 상동단백질군을 조작하고 분석합니다.  HyperProtein은  우리의 손끝에서 손쉽게 분자 전개를 할 수 있도록 하며, 그래픽, 분자역학, 그리고 각종 분자 모델링적 특징을 이용해서 시퀀싱을 3차원모델링의 세계로 변모시킵니다.


HyperProtein은 이러한 시퀀스를 정렬하고. 종의 계통발생 관계를 구축하고 관계 내에 있는 원형종의 시퀀스를 생성합니다. 그리고 당신은 HyperProtein를 통해 protein family를 대표하는 3차원 단백질 구조 내의 변화를 찾는 것을 포함한 계통수의 진화 가지에 따른 차이를 찾을 수 있습니다. 표면, 활성부위 등등에 대해 생쥐에서 인간까지 어떠한 단백질 구조 변화가 일어났습니까? 진화는 어떻게 단백질의 3 D 기능성에 영향을 주었습니까?

시퀀스로부터 단백질 구조를 미리 예측하는데 대한 전세계적 문제가 해결되지 않았지만, HyperProtein 는 이러한 중요한 문제를 해결할 수 있습니다. HyperProtein 는 시퀀스에서 이차 구조를 예측하기 위해 신경 회로망을 사용하며, 분자공학적으로 어떠한 크기의 구조든지 최적화를 시킬 수 있습니다. 상동 단백질 구조가 이용가능할 때, 시퀀스로부터 단백질의 3D 구조를 예측합니다. 시퀀스 분석과 분자 모델링을 함께 이용하십시오!


시퀀스 해석과 분자모델링을 겸비한 HyperProtein을 경험해 보십시요!!

HyperCube announces the release of their newest product HyperProtein 1.0

Featuring:
▶ 프로젝트 와 생물 정보학 및 계통발생론에 대한 CUI 접근법이 가능한 멀티 윈도우 어플리케이션
▶ 분자 모델링을 위한 생물 정보학의 결합
▶ 단백질과 관련된 HyperChem의 모든 특징이 HyperProtein에 포함됨.
▶ 단백질 시퀀스를 다양하게 조작, 분석, 표시
▶ 단백질군의 멀티시퀀스 분석(MSA)
▶ 단백질의 진화적 변화를 MSAs에서 만든 계통수를 통해 생성하고 표시
▶ 단백질 시퀀스에서 나타나는 진화적 변화를 3차원 결과로 분석
▶ 대표적인 단백질 구조에서 단백질 시퀀스 변화와 3D 변화 사이의 직접 연결
▶ 1차적 시퀀스에서 2차적 구조를 예측
▶ 시퀀스 및 그특징을 통합적으로 그래프 분석


▶ Multiple Sequence Alignment(MSA)
▶ Profile alignment
▶ Creation of ancestral sequence
▶ Phylogenetic tree generation and display
▶ Mapping of phylogenetic tree to structure
▶ Various colorings of sequences and mappings
▶ Perl scripting and TCL scripting support
▶ Rich project approach and windowing
▶ Prediction of secondary structure
▶ Homology
▶ Mapping of MSA properties to structure